Konta osobiste w aplikacji Microsoft Authenticator, takie jak konto bankowe, konto Amazon lub osobiste konto Gmail, zawierają generator sześciocyfrowych kodów. Generator ten jest uwzględniony w kopii zapasowej aplikacji i po przywróceniu na nowym telefonie jest gotowy do użycia.
Konta służbowe i szkolne są celowo zróżnicowane. Dane uwierzytelniające, które zatwierdzają Państwa logowanie, nigdy nie opuszczają telefonu, na którym zostały utworzone. Podczas przywracania kopii zapasowej przywracana jest jedynie nazwa konta jako symbol zastępczy, a nowy telefon musi się zalogować raz, aby uzyskać własne dane uwierzytelniające. Klucze dostępu przechowywane w aplikacji są również powiązane z telefonem, więc są one tworzone od nowa na nowym urządzeniu. Dlatego osoby, które przywracają kopię zapasową i widzą czerwony komunikat „Zaloguj się, aby dodać swoje konto”, sądzą, że coś poszło nie tak. Nic takiego się jednak nie stało.