Persönliche Konten in Microsoft Authenticator, wie beispielsweise Ihre Bank, Amazon oder ein privates Gmail-Konto, speichern einen Generator für sechsstellige Codes. Dieser Generator ist in der Sicherung der App enthalten und steht auf dem neuen Smartphone sofort einsatzbereit zur Verfügung.
Arbeits- oder Schulkonten unterscheiden sich bewusst voneinander. Die Anmeldedaten, mit denen Ihre Anmeldung autorisiert wird, verlassen niemals das Smartphone, auf dem sie erstellt wurden. Bei der Wiederherstellung aus einem Backup wird lediglich der Kontoname als Platzhalter wiederhergestellt, und das neue Smartphone muss sich einmal anmelden, um eigene Anmeldedaten zu erhalten. Auch die in der App gespeicherten Passkeys sind an das Smartphone gebunden, sodass sie auf dem neuen Gerät neu erstellt werden. Aus diesem Grund glauben Nutzer, die ein Backup wiederherstellen und den roten Hinweis „Melden Sie sich an, um Ihr Konto hinzuzufügen“ sehen, dass etwas schiefgelaufen ist. Das ist jedoch nicht der Fall.